晴朗时(🙌)节，江(jiāng )户(🙄)川(chuān )柯(kē )(👓)南（高山南 配音）和毛利小五郎（(🤲)小(🕙)山力也 配音）、小兰（(🐀)山崎和佳奈 配音）以及少年侦探团的(de )伙伴们一同来(lái )到京(jīng )都，他(🏻)们即将(jiāng )(⛏)登上自卫队的宙斯(sī )盾战舰，体验一把出(chū )海作战的感觉，期间(🤥)还结识(🔤)了美丽又有着几(♌)分神秘的(de )女自卫(🏴)队员藤(téng )井七海（柴咲幸 配(💣)音）。谁(📞)知快乐的氛围很快被恐慌(🎦)所替(tì )代，战舰(👚)上突(tū )然(👩)发现一条(❓)断(duàn )掉的(de )手臂(bì )(🎴)，消失的(de )自卫队员又引起军方的(🈳)恐(🐈)慌与猜(🔍)测。原来某国(guó )神秘间(👼)谍(dié )X已悄悄登上(shàng )(🈸)宙斯(sī )盾(🛌)，伺机(🎞)盗取战舰上的绝(🏗)密情报。
　　为了找(zhǎo )出隐藏的(de )对(duì )手，柯南(nán )和(🎅)灰原哀（(🐁)林原惠美 配音）(🤺)、(🌥)阿(🌳)笠(🌔)博(🍢)士（绪(xù )方(⚡)贤一 配音）、服部平次（堀(😇)川亮(liàng ) 配(pèi )音(yīn )）以(😀)及(jí )远(♉)山(shān )和(hé )叶(yè )（(❔)宫村优子(zǐ ) 配音(🐁)）通(tōng )力合作，与间谍展开连(lián )番斗智斗(dòu )勇的(de )(😜)较(☕)量…